北京市门头沟区中医医院始建于 1956 年，1998 年晋升为二级甲等中医医院。
现医院拥有编制床位 226 张，实际开放 120 张，设有四个病区；在职职工340人，其中博士2人，硕士 46 人，本科生134人，正高级职称10人，副高级职称19人，中级职称96人。有北京市级老中医药专家学术经验继承工作指导教师一名，首都群众喜爱的中青年名中医一人，门头沟区青年人才两名，人才梯队基本完善。
医院设有骨伤科、脑病科、内分泌科、外科、肛肠科、皮肤科、针灸科、康复科、眼科等17个临床科室，放射、检验、药剂等5个医技科室；其中脑病科为北京市 十二五 重点专科，骨伤科为北京市重点中医专科，并获国家级农村医疗机构中医特色专科称号；临床中运用中药、针灸、理疗、康复、手法、针刀等手段，治疗中风、眩晕、面瘫、腰椎间盘突出、肩周炎、桡骨远端骨折、糖尿病合并冠心病、脑梗塞、下肢大血管病变等疾病，疗效良好，在本地区知名度高。
2012年6月，医院加入门头沟区医院集团，7月份正式启动了门诊楼、病房楼的装修改造工程，工程历时四个月，现已竣工并正式开诊。医院聘请专业设计公司对门诊楼、病房楼进行了整体规划设计，装修改造后，大楼的内饰更具中国传统特色，门诊大厅以中式书法阴刻的方式展示《黄帝内经》几千年的文化内涵；各楼层病房、诊室以梅、兰、竹、菊图案和相对应的色彩结合中式传统回纹图案，浑然一体；取药区、等候区采用中式借景手法，把室外竹林景致与室内空间融为一体，相得益彰。让患者在诊疗的同时，感受到人与自然的和谐统一，体会到中医文化的博大精深。
在新管理团队的带领下，全院职工齐心协力，和谐奋进，努力建成具有中医传统特色的现代化中医医院。
