医院现有国家中医药管理局重点学(专)科4个:中医全科、中西医结合临床、中医肿瘤科、老年科;上海市医学重点专科建设项目5个:心血管内科、肾内科、急诊科、内分泌科、普通外科;药学部为 上海市临床药学重点专科建设项目(区属)单位 ;心内科获得首届唯一的普陀区优势学科建设项目资助,并且成功通过国家胸痛中心、心衰中心、房颤中心、高血压达标中心以及心脏康复中心的认证,成为上海仅有的二家同时具备五个心脏中心的区域诊疗中心之一;呼吸与危重症学科、内分泌代谢科、肿瘤科、肾内科获得普陀区特色专科建设项目资助。医院还拥有普陀区特色专病建设项目5项,分别是大肠癌、脑卒中、下肢动脉硬化闭塞症、胆石病和尿石症。获得普陀区中医临床重点专科4个,即中西医结合肿瘤科、中医治未病科、传统中医科(脑病康复)、中西医结合康复科。
近年医院加大科研投入,拥有中西医结合肿瘤实验室(校级);9个试验平台,建筑面积近2000平方米;SPF级实验室;5个专科实验室。累计获得74项国家自然科学基金和330余项市局级课题项目;累计发表核心期刊论文近410篇、SCI收录论文300余篇;获得市局级以上科研教学奖项等共50余项。
目前医院已建成了国家级-市级-区级多层次、多元化的专科建设群,在一定程度上为医院学术创新、持续发展提供了核心内在动力,充分发挥了示范、引领、带动和辐射区域发展的作用。