重庆医科大学附属儿童医院于1956年由上海医学院儿科系迁渝创建，是集医教研为一体的国家三级甲等综合性儿童医院，国家儿童区域医疗中心（西南）、国家一流本科建设单位、国家临床医学研究中心。国家发改委优质医疗资源输出单位。
医院以提高儿童健康水平和促进儿科医学事业发展为宗旨，以科教引领和仁心仁术护佑儿童健康为核心理念，以建设国内一流，国际先进，集医疗、教学、 科研、仁爱为一体的儿童医学中心为发展目标；坚持以国家需求为导向、以学科建设为引领、以组织绩效目标管理为主线，推进医疗、教学、科研和管理全面发展。
医院是最早被国家授予儿科学硕士、博士学位授予点、博士后流动站，是首批儿科学国家重点学科、教育部重点实验室、国家级国际科技合作示范基地、国家级继续医学教育基地、国家级教学团队、国家精品课程、国家食品药品监督管理局药物临床试验机构、全国儿科唯一的住院医师规范化培训示范基地、国家级儿童早期发展示范基地、儿科唯一获得肝移植资质的儿童医院、国家干细胞临床研究备案机构；拥有5个重庆市重点实验室和3个工程中心,全国文明单位。在全国最佳医院排行榜中连续11年蝉联专科综合排行前三甲，2020年度儿内科居全国儿童医院第三位，儿外科与复旦儿外科并列第二位，连续12年进入中国医院百强榜。2020年中国医院科技量值(SETM)排名中，我院综合居全国儿童医院第三位、儿科学居第三位。
医院现有教职员工4300余名，博士生导师46名，高级职称专家314名、享受政府特殊津贴专家15名。是中华医学会儿科学分会常委单位、中华预防医学会儿童保健分会副主任委员单位，是《中华儿科杂志》、《中华小儿外科杂志》、《中国实用儿科杂志》、《临床小儿外科杂志》等杂志副总编、副主编单位及国内10余家杂志副总编和编委单位；是国家规划教材《儿科学》第六版主编和第七、八版副主编单位；是统编教材《儿童保健学》第一版主编和第二、三版共同主编单位；是《小儿外科学》第四、五版、六版和《儿科人文与医患沟通》共同主编单位，《小儿传染病学》第四版、《儿科双语教材》、《儿科医生实习手册》副主编单位。是重庆市医学会儿科专委会及小儿外科专委会、重庆市康复医学会、重庆市营养学会妇幼营养专委会主任委员单位，重庆医院协会后勤专委会主任委员单位。
医院是国家儿童区域医疗中心。医院现有渝中院区和两江院区两个院区，共编制床位2480张。平均开放2200张。2021年门急诊量达到366.82万人次，住院量10.22万人次，外埠病人比例近40%。医院专业设置齐全，有42个临床和医技科室，是美国心脏协会（AHA）授权认证的心血管急救培训中心、全国联网的儿童急救中心、全国首批 出生缺陷干预救助示范基地 、国家卫生计生委先心病介入培训；是重庆市哮喘防治中心、重庆市危重新生儿及早产儿急救中心、重庆市儿童营养研究中心、重庆市新生儿筛查机构、重庆市儿童创伤诊治中心、重庆市儿童五官诊治中心、重庆市儿童发育行为与心理健康中心、重庆市儿童康复中心、重庆市儿童危急重症救治中心。儿童重症医学、小儿呼吸科、新生儿科、小儿外科、儿科临床护理获国家临床重点专科建设项目。罕见病（PID）诊治技术、肝移植技术、脐带血造血干细胞治疗技术、先天性心脏病介入诊疗技术、介入肺科学技术、儿童癫痫手术、微创外科手术、极低出生体重儿综合救治及HIFU治疗儿童实体肿瘤等技术均达国家一流水平。
